Infection virale : persistance, réponse de l’hôte et physiopathologie

Responsable : J. Izopet

Objectifs Scientifiques


Notre laboratoire s’intéresse à la physiopathologie des infections par le virus de l’immunodéficience humaine (HIV), le virus de l’hépatite E (HEV) et le virus zika (ZIKV). Nous étudions les mécanismes de persistance de ces virus chez l’hôte immunocompétent (HIV, ZIKV) ou chez l’immunodéprimé (HEV). Nous étudions les mécanismes d’entrée du HIV par les récepteurs de chimiokines, ainsi que la physiopathologie de l’infection HIV dans la muqueuse intestinale. Nous étudions également de manière détaillée les modes de transmission et la pathogénèse du HEV et du ZIKV au cours de la grossesse. Nos travaux reposent sur des modèles cellulaires originaux (explants placentaires, cytotrophoblastes extravilleux primaires, hépatocytes, entérocytes, lymphocytes circulants et tissulaires) et des échantillons cliniques (tissu intestinal, placentas précoces et à terme, sang et biopsies de patients immunodéprimés).

Nos Projets


AXE 1: HIV

Notre laboratoire développe un large éventail d’approches dans les domaines de l’immunologie, de la virologie, de la pharmacologie moléculaire et de la biologie structurale pour étudier des aspects importants de la physiopathologie de l’infection à VIH et du sida. Nous sommes profondément ancrés à l’interface entre les recherches fondamentales et cliniques et bénéficions de la proximité du CHU de Toulouse. Nos recherches s’articulent autour de deux axes principaux, qui sont eux-mêmes fortement interconnectés.


Mécanismes d’entrée du VIH-1 et leurs conséquences physiopathologiques

PI: B. Lagane; Participants: P. Colin, B. Puissant, S. Raymond, M. Armani

Nous étudions les propriétés d’interactions entre les glycoprotéines de l’enveloppe VIH-1 (Env) et leurs récepteurs cellulaires, i.e. CD4 et selon le tropisme viral, les corécepteurs CCR5 ou CXCR4. Nous étudions comment ces interactions sont régulées par des facteurs des cellules cibles et les réponses immunitaires de l’hôte et, inversement, comment le virus modifie les fonctions cellulaires et l’immunité de l’hôte. Enfin, nous cherchons à caractériser comment les propriétés de l’entrée virale façonnent les propriétés phénotypiques des virus et leur rôle dans les différents processus et stades de l’infection à VIH-1. Cela concerne en premier lieu l’étape la plus précoce de l’infection, à savoir la transmission du virus. Nous cherchons à identifier si des déterminants d’Env conduisent à la sélection de virus pendant la transmission et favorisent les premières étapes de l’établissement d’une infection chez l’hôte (Projet #1). Nous étudions également comment les propriétés de l’entrée virale changent au cours de l’infection et, ce faisant, contribuent à sa pathogenèse, en particulier la déplétion des lymphocytes T CD4. À cet égard, nous étudions le rôle que les ligands naturels des corécepteurs, c’est-à-dire plusieurs chimiokines CC pour CCR5 et CXCL12 pour CXCR4, pourraient jouer comme force motrice de l’évolution des propriétés des virus utilisant CCR5 ou CXCR4 comme corécepteurs (Projet #2). Un troisième projet porte sur la façon dont les propriétés des interactions d’Env avec les récepteurs cellulaires régulent le tropisme cellulaire des virus, en particulier leur capacité à entrer dans les macrophages. Ces cellules jouent un rôle essentiel dans la physiopathologie de l’infection à VIH-1. Elles forment des réservoirs viraux et contribuent à la dissémination du virus dans les tissus, en particulier dans le système nerveux central, ce qui a été lié au développement de troubles neurologiques chez les patients. Sur ce sujet, nous poursuivons actuellement nos récents travaux (Colin, PLoS Pathog., 2018) sur le rôle de l’hétérogénéité conformationnelle du CCR5 dans l’entrée du VIH-1 dans les macrophages, tant dans le contexte de l’infection par des virus libres que lors du transfert des virus entre lymphocytesT CD4 infectés et macrophages (Projet #3). Nos travaux portent enfin sur la caractérisation des voies de signalisation intracellulaires qui découlent des interactions entre Env primaires et CCR5, lesquelles sont supposées contribuer à de nombreux aspects de la physiopathologie de l’infection. Nous supposons que la signalisation des Envs pourrait dépendre de la ou des conformation(s) de CCR5 auxquelles elles se lient, et que ce processus contribue aux différences dans les propriétés phénotypiques des différentes souches de VIH-1. Nous étudions actuellement cette question à l’aide de méthodes basées sur la technique du Transfert d’Energie de Résonance par Bioluminescence (BRET) pour suivre, en temps réel et dans les cellules vivantes, les événements les plus en amont de la signalisation du CCR5, i.e. les interactions avec les protéines G et les arrestines (Projet #4).

Persistance du VIH-1 et insuffisance de la reconstitution immunitaire intestinale des patients traités

PI: P. Delobel; Participants: M. Nayrac, C. Vellas, M. Cazabat, M. Requena

Une reconstitution immunitaire incomplète au niveau intestinal chez les patients infectés par le VIH-1, même sous traitement anti rétroviral efficace, entraîne une altération persistante de l’intégrité de l’épithélium, une translocation microbienne et une inflammation chronique à l’origine de maladies autres que le sida, telles que les maladies métaboliques et cardio-vasculaires. . Nous avons contribué à une meilleure compréhension des mécanismes qui entraînent une altération du recrutement des lymphocytes T CD4 dans l’intestin, notamment les cellules Th17, une sous-population des lymphocytes T essentielle à la défense de la muqueuse intestinale contre les agents pathogènes (Mavigner, J Clin Invest, 2012; Loiseau , Mucosal Immunol, 2016). Nous avons constaté que cette diminution du recrutement est due à une diminution de la production de certaines chimiokines par les entérocytes des patients infectés par le VIH-1, en particulier CCL20 et CCL25. En revanche, d’autres sous-populations de cellules T intestinales restent efficacement recrutés, telles que les cellules Th1 et les cellules T CD8 effectrices par chimiotactisme induit par CXCR3 (Loiseau, J Infect Dis, 2019). Elles contribuent en outre au recrutement des cellules Th17 par des mécanismes médiés par l’IFN-et l’IL-18, tout en augmentant la proportion de cellules Treg, perpétuant ainsi un déséquilibre Th17/Treg. Nous avons également constaté que, contrairement aux cellules Th17, les cellules Th22 peuvent être efficacement recrutées dans l’intestin par l’axe CCL28-CCR10, en tant qu’alternative à l’axe CCL20-CCR6 modifié chez les patients infectés par le VIH-1 et traités par cART. Nous poursuivons actuellement nos travaux pour mieux comprendre le réseau de chimiokines qui régit le recrutement des lymphocytes T dans la muqueuse intestinale, notamment les mécanismes impliqués dans la régulation négative de CCL20 et CCL25. Nous avons développé un modèle ex-vivo de cultures d’entérocytes primaires humains sur des transwells afin d’étudier la production de chimiokines par les entérocytes et les interactions lymphocytes T / entérocytes dans des co-cultures (projet 1).
La deuxième partie de nos travaux concerne la persistance du VIH-1 dans la muqueuse intestinale malgré le traitement anti-rétroviral. Nous avons récemment découvert que la réplication virale résiduelle persiste malgré le traitement anti-rétroviral et reconstitue les réservoirs viraux de la muqueuse intestinale des patients traités. La stimulation antigénique chronique qui en résulte induit le recrutement des cellules T spécifiques du VIH-1 dans l’intestin et contribue à altérer la reconstitution des cellules T CD4. Nous visons à mieux définir les réservoirs du virus et les cellules cibles du VIH-1 dans la muqueuse intestinale à l’aide de biopsies intestinales de patients traités et en utilisant un modèle ex vivo d’histoculture intestinale (projet n ° 2).

Enfin, la troisième partie de notre travail est consacrée à l’étude des mécanismes du déséquilibre Th17/Treg, ainsi que de ceux responsables de l’épuisement des lymphocytes T dans l’intestin de patients traités. Nous avons récemment prélevé des biopsies endoscopiques intestinales à différents niveaux (duodénum, iléon et côlon) chez des patients bien caractérisés infectés par le VIH-1 sous traitement anti-rétroviral (n = 40) et chez des témoins non infectés (n = 40) recrutés à l’hôpital universitaire de Toulouse au travers de l’étude l’ANRS (Étude EP61 GALT ; PI : P. Delobel). Ces échantillons seront utilisés pour effectuer des analyses approfondies des réservoirs de virus (ARN et ADN associés aux cellules, NGS de provirus) et de la réponse des cellules T muqueuses, notamment des Treg et des cellules T épuisées (projet 3).

AXE 2: HEV

Pathogénèse de l’infection par le HEV

Rôle des lymphocyte T gamma delta lors de l’infection par HEV

PI : E. Champagne ; Participants: F. Abravanel, H. El Costa.

Le virus de l’hépatite E (HEV, génotype 3) est responsable d’infections chroniques chez les patients immunodéprimés. La persistance virale est liée à l’état immunologique des patients mais les déterminants sont largement inconnus. Nous nous sommes engagés à étudier les lymphocytes T γδ dans le contexte des infections virales humaines et nous avons observé que les lymphocytes T γδ présentent des marqueurs d’activation et de mobilisation chez les patients immunodéprimés à la phase aiguë de l’infection par HEV. Nous visons à clarifier leur rôle et si leur activation est bénéfique ou nuisible. Notre travail est basé sur l’analyse d’échantillons sanguins prélevés chez des patients à la phase aiguë, résolutive ou chronique d’infection. Bien que rarement symptomatiques, les infections aiguës chez les individus immunocompétents sont parfois diagnostiquées et permettent d’étudier l’immunité antivirale dans un contexte immunocompétent. La réactivité des lymphocytes T γδ contre les cellules infectées par le HEV est également étudiée dans des modèles d’infection in vitro, ce qui a révélé que le virus est capable de moduler les réponses des lymphocytes T γδ à certaines cytokines et favorisent leurs propriétés immunorégulatrices. Notre objectif est de déterminer si les propriétés immunomodulatrices du HEV opèrent in vivo et peuvent être ciblées à des fins thérapeutiques.

Etude du cycle de réplication du HEV

Rôle de l’autophagie dans le bourgeonnement du HEV

PI: S. Chapuy-Regaud ; Participants: J. Izopet, N. Capelli.

Le bourgeonnement de la forme quasi enveloppée du virus de l’hépatite E (eHEV) dépend de la voie d’exocytose. Nous avons développé un système de culture du HEV sur cellules polarisées qui permet de reproduire les principales caractéristiques des hépatocytes (notamment la sécrétion polarisée de l’albumine et des d’acides biliaires et l’expression de ZO-1). Dans ce système, le eHEV est libéré sous une forme infectieuse, préférentiellement au pôle biliaire ; nos résultats préliminaires montrent également le rôle de l’autophagie. Notre objectif est de comprendre comment exocytose et autophagie sont détournées par le eHEV pour sa libération et quelles sont leurs interactions au niveau moléculaire. Dans ce but, nous étudions les caractéristiques des particules eHEV par protéomique et lipidomique et les événements intracellulaires impliqués par extinction de l’expression de protéines cibles par des shRNA et mise en œuvre de méthodes d’imagerie.

Réplication du HEV dans les entérocytes

PI: J. Izopet ; Participants: O. Marion, M. Migueres, S. Lhomme.

L’épithélium intestinal est la première barrière que le HEV doit franchir avant de rejoindre la circulation sanguine porte et accéder au foie. Les mécanismes par lesquels le HEV franchit les jonctions serrées de l’épithélium intestinal sont inconnus. Les données obtenues à partir d’un modèle animal indiquent que l’intestin est un site important de réplication extra-hépatique du HEV et que la lignée cellulaire d’adénocarcinome humain Caco-2 est permissive au HEV. Nos données provenant de patients pour lesquels un traitement par ribavirine a échoué suggèrent que l’intestin pourrait être un important réservoir pour le HEV. Le rôle des cellules M intestinales dans la réplication du HEV ou de la transcytose est inconnu. Nos données préliminaires provenant de cultures de cellules épithéliales primaires de l’intestin grêle, polarisées sur des inserts, indiquent que les entérocytes sont permissifs à HEV-1 et HEV-3 et libèrent des particules de HEV quasienveloppées, préférentiellement du côté apical. Nos principaux objectifs sont: (1) d’étudier la localisation du HEV dans la muqueuse intestinale après infection ex vivo d’explants intestinaux (2), d’étudier les modifications de la perméabilité des cellules épithéliales induites par l’infection par le HEV (3), de déterminer la localisation subcellulaire des protéines virales (4) d’évaluer le rôle des cellules M dans la réplication ou la transcytose du HEV (5) d’étudier l’effet de la ribavirine et de l’interféron alpha sur la production du virus (6)d’étudier les voies de signalisation immunitaires innées après l’entrée du virus (HEV-1 vs HEV-3) et la production de cytokines.

AXE 3: ZIKV

Le développement d’une réponse immune adéquate et contrôlée est cruciale pour maintenir l’homéostasie de l’’organisme. Une réponse déséquilibrée peut conduire à des maladies auto-immunes si le système immunitaire réagit trop fortement ou permet une expansion tumorale due à une réponse immunitaire insuffisante.

Nous étudions la réplication du ZIKV dans le compartiment génital et au niveau de l’interface materno-fœtale. Nous avons montré que le ZIKV provoquait des lésions au niveau de la decidua basalis maternelle, du placenta fœtal et du cordon ombilical. Nous avons également observé que le virus infectait une grande diversité de cellules : les fibroblastes de la decidua, le trophoblaste et les cellules mésenchymateuses du cordon ombilical.

Nous avons montré que le virus était présent dans le sperme des patients infectés pendant une période prolongée et que les spermatozoïdes étaient porteurs d’antigènes viraux. Nous étudions à présent les mécanismes de persistance du virus dans le compartiment génital.

Autres informations


Publications

2019

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Braun, P; Delgado, R; Drago, M; Fanti, D; Fleury, H; Izopet, J; Lombardi, A; Mancon, A; Marcos, M A; Saune, K; S, Shea O; Perez-Rivilla, A; Ramble, J; Trimoulet, P; Vila, J; Whittaker, D; Artus, A; Rhodes, D

A European multicenter study on the analytical performance of the VERIS HBV assay Article de journal

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Raymond, S; Nicot, F; Carcenac, R; Lefebvre, C; Jeanne, N; Saune, K; Delobel, P; Izopet, J

HIV-1 genotypic resistance testing using the Vela automated next-generation sequencing platform Article de journal

J Antimicrob Chemother, 73 (5), p. 1152-1157, 2018, ISSN: 1460-2091 (Electronic) 0305-7453 (Linking).

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Bisseux, M; Colombet, J; Mirand, A; Roque-Afonso, A M; Abravanel, F; Izopet, J; Archimbaud, C; Peigue-Lafeuille, H; Debroas, D; Bailly, J L; Henquell, C

Monitoring human enteric viruses in wastewater and relevance to infections encountered in the clinical setting: a one-year experiment in central France, 2014 to 2015 Article de journal

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Dalton, H R; Izopet, J

Transmission and Epidemiology of Hepatitis E Virus Genotype 3 and 4 Infections Article de journal

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Mallet, V; Sberro-Soussan, R; Roque-Afonso, A M; Vallet-Pichard, A; Deau, B; Portal, A; Chaix, M L; Hauser, L; Beyloune, A; Mercadier, A; Izopet, J; Legendre, C; Pol, S

Transmission of Hepatitis E Virus With Plasma Exchange in Kidney Transplant Recipients: A Retrospective Cohort Study Article de journal

Transplantation, 102 (8), p. 1351-1357, 2018, ISSN: 1534-6080 (Electronic) 0041-1337 (Linking).

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Kamar, N; Pischke, S

Acute and Persistent Hepatitis E Virus Genotype 3 and 4 Infection: Clinical Features, Pathogenesis, and Treatment Article de journal

Cold Spring Harb Perspect Med, 2018, ISSN: 2157-1422 (Electronic) 2157-1422 (Linking).

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Nicot, F; Jeanne, N; Raymond, S; Delfour, O; Carcenac, R; Lefebvre, C; Saune, K; Delobel, P; Izopet, J

Performance comparison of deep sequencing platforms for detecting HIV-1 variants in the pol gene Article de journal

J Med Virol, 90 (9), p. 1486-1492, 2018, ISSN: 1096-9071 (Electronic) 0146-6615 (Linking).

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Lambert-Niclot, S; Grude, M; Meynard, J L; Marcelin, A G; Valantin, M A; Flandre, P; Izopet, J; Moinot, L; Bouteloup, V; Calvez, V; Katlama, C; Girard, P M; Morand-Joubert, L

Ultrasensitive Human Immunodeficiency Virus Type 1 Viral Load as a Marker of Treatment Choice for Simplification Strategies Article de journal

Clin Infect Dis, 67 (12), p. 1883-1889, 2018, ISSN: 1537-6591 (Electronic) 1058-4838 (Linking).

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Grellier, J; Hirsch, H H; Mengelle, C; Esposito, L; Hebral, A L; Belliere, J; Weissbach, F; Izopet, J; Del Bello, A; Kamar, N

Impact of donor BK polyomavirus replication on recipient infections in living donor transplantation Article de journal

Transpl Infect Dis, 20 (4), p. e12917, 2018, ISSN: 1399-3062 (Electronic) 1398-2273 (Linking).

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Marion, O; Abravanel, F; Del Bello, A; Esposito, L; Lhomme, S; Puissant-Lubrano, B; Alric, L; Faguer, S; Izopet, J; Kamar, N

Hepatitis E virus-associated cryoglobulinemia in solid-organ-transplant recipients Article de journal

Liver Int, 38 (12), p. 2178-2189, 2018, ISSN: 1478-3231 (Electronic) 1478-3223 (Linking).

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Nicot, F; Jeanne, N; Roulet, A; Lefebvre, C; Carcenac, R; Manno, M; Dubois, M; Kamar, N; Lhomme, S; Abravanel, F; Izopet, J

Diversity of hepatitis E virus genotype 3 Article de journal

Rev Med Virol, 28 (5), p. e1987, 2018, ISSN: 1099-1654 (Electronic) 1052-9276 (Linking).

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Abravanel, F; Lhomme, S; Chapuy-Regaud, S; Mansuy, J M; Boineau, J; Saune, K; Izopet, J

A fully automated system using transcription-mediated amplification for the molecular diagnosis of hepatitis E virus in human blood and faeces Article de journal

J Clin Virol, 105 , p. 109-111, 2018, ISSN: 1873-5967 (Electronic) 1386-6532 (Linking).

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Abravanel, F; Pique, J; Couturier, E; Nicot, F; Dimeglio, C; Lhomme, S; Chiabrando, J; Saune, K; Peron, J M; Kamar, N; Evrard, S; de Valk, H; Cintas, P; Izopet, J; study , H E V

Acute hepatitis E in French patients and neurological manifestations Article de journal

J Infect, 77 (3), p. 220-226, 2018, ISSN: 1532-2742 (Electronic) 0163-4453 (Linking).

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Mansuy, J M; Lhomme, S; Cazabat, M; Pasquier, C; Martin-Blondel, G; Izopet, J

Detection of Zika, dengue and chikungunya viruses using single-reaction multiplex real-time RT-PCR Article de journal

Diagn Microbiol Infect Dis, 92 (4), p. 284-287, 2018, ISSN: 1879-0070 (Electronic) 0732-8893 (Linking).

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Raymond, S; Delaugerre, C; Nicot, F; Assoumou, L; Lancar, R; Beniguel, L; Izopet, J; study , Anrs Optimal

Accurate quantification of CXCR4-using HIV-1 variants by Illumina deep-sequencing Article de journal

AIDS, 32 (16), p. 2429-2431, 2018, ISSN: 1473-5571 (Electronic) 0269-9370 (Linking).

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Jadoul, M; Berenguer, M C; Doss, W; Fabrizi, F; Izopet, J; Jha, V; Kamar, N; Kasiske, B L; Lai, C L; Morales, J M; Patel, P R; Pol, S; Silva, M O; Balk, E M; Gordon, C E; Earley, A; Di, M; Martin, P

Executive summary of the 2018 KDIGO Hepatitis C in CKD Guideline: welcoming advances in evaluation and management Article de journal

Kidney Int, 94 (4), p. 663-673, 2018, ISSN: 1523-1755 (Electronic) 0085-2538 (Linking).

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Abravanel, F; Lacipiere, A; Lhomme, S; Dubois, M; Minier, L; Peron, J M; Alric, L; Kamar, N; Izopet, J

Performance of a commercial assay for detecting and quantifying HEV RNA in faeces Article de journal

J Clin Virol, 109 , p. 1-5, 2018, ISSN: 1873-5967 (Electronic) 1386-6532 (Linking).

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Capelli, N; Marion, O; Dubois, M; Allart, S; Bertrand-Michel, J; Lhomme, S; Abravanel, F; Izopet, J; Chapuy-Regaud, S

Vectorial Release of Hepatitis E Virus in Polarized Human Hepatocytes Article de journal

J Virol, 2018, ISSN: 1098-5514 (Electronic) 0022-538X (Linking).

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Dimeglio, C; Beau, F; Broult, J; Gouy, P; Izopet, J; Lastere, S; Abravanel, F

Hepatitis E prevalence in French Polynesian blood donors Article de journal

PLoS One, 13 (12), p. e0208934, 2018, ISSN: 1932-6203 (Electronic) 1932-6203 (Linking).

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Dimeglio, C; Raymond, S; Nicot, F; Jeanne, N; Carcenac, R; Lefebvre, C; Izopet, J; French National Agency for Research on, Aids ; Viral Hepatitis, Resistance Study Group A C

Impact of the mutational load on the virological response to a first-line rilpivirine-based regimen Article de journal

J Antimicrob Chemother, 2018, ISSN: 1460-2091 (Electronic) 0305-7453 (Linking).

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2017

Lhomme, S; Bardiaux, L; Abravanel, F; Gallian, P; Kamar, N; Izopet, J

Hepatitis E Virus Infection in Solid Organ Transplant Recipients, France Article de journal

Emerg Infect Dis, 23 (2), p. 353-356, 2017, ISSN: 1080-6059 (Electronic) 1080-6040 (Linking).

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Hocine, H R; Costa, H E; Dam, N; Giustiniani, J; Palacios, I; Loiseau, P; Bensussan, A; Borlado, L R; Charron, D; Suberbielle, C; Jabrane-Ferrat, N; Al-Daccak, R

Minimizing the risk of allo-sensitization to optimize the benefit of allogeneic cardiac-derived stem/progenitor cells Article de journal

Sci Rep, 7 , p. 41125, 2017, ISSN: 2045-2322 (Electronic) 2045-2322 (Linking).

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Dam, N; Hocine, H R; Palacios, I; DelaRosa, O; Menta, R; Charron, D; Bensussan, A; El Costa, H; Jabrane-Ferrat, N; Dalemans, W; Lombardo, E; Al-Daccak, R

Human Cardiac-Derived Stem/Progenitor Cells Fine-Tune Monocyte-Derived Descendants Activities toward Cardiac Repair Article de journal

Front Immunol, 8 , p. 1413, 2017, ISSN: 1664-3224 (Print) 1664-3224 (Linking).

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Srivastava, R; Khan, A A; Chilukuri, S; Syed, S A; Tran, T T; Furness, J; Bahraoui, E; BenMohamed, L

CXCL10/CXCR3-Dependent Mobilization of Herpes Simplex Virus-Specific CD8(+) TEM and CD8(+) TRM Cells within Infected Tissues Allows Efficient Protection against Recurrent Herpesvirus Infection and Disease Article de journal

J Virol, 91 (14), 2017, ISSN: 1098-5514 (Electronic) 0022-538X (Linking).

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Serrero, M; Planes, R; Bahraoui, E

PKC-delta isoform plays a crucial role in Tat-TLR4 signalling pathway to activate NF-kappaB and CXCL8 production Article de journal

Sci Rep, 7 (1), p. 2384, 2017, ISSN: 2045-2322 (Electronic) 2045-2322 (Linking).

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Donnelly, M C; Imlach, S N; Abravanel, F; Ramalingam, S; Johannessen, I; Petrik, J; Fraser, A R; Campbell, J D; Bramley, P; Dalton, H R; Hayes, P C; Kamar, N; Simpson, K J

Sofosbuvir and Daclatasvir Anti-Viral Therapy Fails to Clear HEV Viremia and Restore Reactive T Cells in a HEV/HCV Co-Infected Liver Transplant Recipient Article de journal

Gastroenterology, 152 (1), p. 300-301, 2017, ISSN: 1528-0012 (Electronic) 0016-5085 (Linking).

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Abravanel, F; Lhomme, S; Fougere, M; Saune, K; Alvarez, M; Peron, J M; Delobel, P; Izopet, J

HEV infection in French HIV-infected patients Article de journal

J Infect, 74 (3), p. 310-313, 2017, ISSN: 1532-2742 (Electronic) 0163-4453 (Linking).

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Raymond, S; Nicot, F; Jeanne, N; Delfour, O; Carcenac, R; Lefebvre, C; Cazabat, M; Saune, K; Delobel, P; Izopet, J

Performance comparison of next-generation sequencing platforms for determining HIV-1 coreceptor use Article de journal

Sci Rep, 7 , p. 42215, 2017, ISSN: 2045-2322 (Electronic) 2045-2322 (Linking).

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Sayed, I M; Foquet, L; Verhoye, L; Abravanel, F; Farhoudi, A; Leroux-Roels, G; Izopet, J; Meuleman, P

Transmission of hepatitis E virus infection to human-liver chimeric FRG mice using patient plasma Article de journal

Antiviral Res, 141 , p. 150-154, 2017, ISSN: 1872-9096 (Electronic) 0166-3542 (Linking).

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Abravanel, F; Goutagny, N; Perret, C; Lhomme, S; Vischi, F; Aversenq, A; Chapel, A; Dehainault, N; Piga, N; Dupret-Carruel, J; Izopet, J

Evaluation of two VIDAS ((R))prototypes for detecting anti-HEV IgG Article de journal

J Clin Virol, 89 , p. 46-50, 2017, ISSN: 1873-5967 (Electronic) 1386-6532 (Linking).

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Mansuy, J M; Mengelle, C; Pasquier, C; Chapuy-Regaud, S; Delobel, P; Martin-Blondel, G; Izopet, J

Zika Virus Infection and Prolonged Viremia in Whole-Blood Specimens Article de journal

Emerg Infect Dis, 23 (5), p. 863-865, 2017, ISSN: 1080-6059 (Electronic) 1080-6040 (Linking).

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Pasquier, C; Saune, K; Raymond, S; Boisneau, J; Courtade, M; Izopet, J

Comparison of Cobas(R) HPV and Anyplex II HPV28 assays for detecting and genotyping human papillomavirus Article de journal

Diagn Microbiol Infect Dis, 87 (1), p. 25-27, 2017, ISSN: 1879-0070 (Electronic) 0732-8893 (Linking).

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Kamar, N; Wang, W; Dalton, H R; Pan, Q

Direct-acting antiviral therapy for hepatitis E virus? Article de journal

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Velay, A; Kack-Kack, W; Abravanel, F; Lhomme, S; Leyendecker, P; Kremer, L; Chamouard, P; Izopet, J; Fafi-Kremer, S; Barth, H

Parsonage-Turner syndrome due to autochthonous acute genotype 3f hepatitis E virus infection in a nonimmunocompromised 55-year-old patient Article de journal

J Neurovirol, 23 (4), p. 615-620, 2017, ISSN: 1538-2443 (Electronic) 1355-0284 (Linking).

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Chapuy-Regaud, S; Dubois, M; Plisson-Chastang, C; Bonnefois, T; Lhomme, S; Bertrand-Michel, J; You, B; Simoneau, S; Gleizes, P E; Flan, B; Abravanel, F; Izopet, J

Characterization of the lipid envelope of exosome encapsulated HEV particles protected from the immune response Article de journal

Biochimie, 141 , p. 70-79, 2017, ISSN: 1638-6183 (Electronic) 0300-9084 (Linking).

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Dorr, G; Del Bello, A; Abravanel, F; Marion, O; Cointault, O; Ribes, D; Lavayssiere, L; Esposito, L; Nogier, M B; Hebral, A L; Saune, K; Izopet, J; Kamar, N

Malignancies in hepatitis C virus-positive and -negative kidney transplant recipients: A case-controlled study Article de journal

Transpl Infect Dis, 19 (4), 2017, ISSN: 1399-3062 (Electronic) 1398-2273 (Linking).

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Yin, X; Li, X; Ambardekar, C; Hu, Z; Lhomme, S; Feng, Z

Hepatitis E virus persists in the presence of a type III interferon response Article de journal

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Metsu, D; Toutain, P L; Chatelut, E; Delobel, P; Gandia, P

Antiretroviral unbound concentration during pregnancy: piece of interest in the puzzle? Article de journal

J Antimicrob Chemother, 72 (9), p. 2407-2409, 2017, ISSN: 1460-2091 (Electronic) 0305-7453 (Linking).

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Abravanel, F; Lhomme, S; El Costa, H; Schvartz, B; Peron, J M; Kamar, N; Izopet, J

Rabbit Hepatitis E Virus Infections in Humans, France Article de journal

Emerg Infect Dis, 23 (7), p. 1191-1193, 2017, ISSN: 1080-6059 (Electronic) 1080-6040 (Linking).

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Moulin, M; Alguacil, J; Gu, S; Mehtougui, A; Adams, E J; Peyrottes, S; Champagne, E

Vgamma9Vdelta2 T cell activation by strongly agonistic nucleotidic phosphoantigens Article de journal

Cell Mol Life Sci, 74 (23), p. 4353-4367, 2017, ISSN: 1420-9071 (Electronic) 1420-682X (Linking).

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Izopet, J; Lhomme, S; Chapuy-Regaud, S; Mansuy, J M; Kamar, N; Abravanel, F

HEV and transfusion-recipient risk Article de journal

Transfus Clin Biol, 24 (3), p. 176-181, 2017, ISSN: 1953-8022 (Electronic) 1246-7820 (Linking).

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Dalton, H R; van Eijk, J J J; Cintas, P; Madden, R G; Jones, C; Webb, G W; Norton, B; Pique, J; Lutgens, S; Devooght-Johnson, N; Woolson, K; Baker, J; Saunders, M; Househam, L; Griffiths, J; Abravanel, F; Izopet, J; Kamar, N; van Alfen, N; van Engelen, B G M; Hunter, J G; van der Eijk, A A; Bendall, R P; McLean, B N; Jacobs, B C

Hepatitis E virus infection and acute non-traumatic neurological injury: A prospective multicentre study Article de journal

J Hepatol, 67 (5), p. 925-932, 2017, ISSN: 1600-0641 (Electronic) 0168-8278 (Linking).

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Joguet, G; Mansuy, J M; Matusali, G; Hamdi, S; Walschaerts, M; Pavili, L; Guyomard, S; Prisant, N; Lamarre, P; Dejucq-Rainsford, N; Pasquier, C; Bujan, L

Effect of acute Zika virus infection on sperm and virus clearance in body fluids: a prospective observational study Article de journal

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Pasquier, C; Walschaerts, M; Raymond, S; Moinard, N; Saune, K; Daudin, M; Izopet, J; Bujan, L

Patterns of residual HIV-1 RNA shedding in the seminal plasma of patients on effective antiretroviral therapy Article de journal

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Barrague, H; Condat, B; Petitdidier, N; Champagne, E; Renou, C; Izopet, J; Abravanel, F

Chronic hepatitis E virus infection in a cirrhotic patient: A case report Article de journal

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Belliere, J; Abravanel, F; Nogier, M B; Martinez, S; Cintas, P; Lhomme, S; Lavayssiere, L; Cointault, O; Faguer, S; Izopet, J; Kamar, N

Transfusion-acquired hepatitis E infection misdiagnosed as severe critical illness polyneuromyopathy in a heart transplant patient Article de journal

Transpl Infect Dis, 19 (6), 2017, ISSN: 1399-3062 (Electronic) 1398-2273 (Linking).

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Kamar, N; Izopet, J; Pavio, N; Aggarwal, R; Labrique, A; Wedemeyer, H; Dalton, H R

Hepatitis E virus infection Article de journal

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de Truchis, P; Assoumou, L; Landman, R; Mathez, D; Le Du, D; Bellet, J; Amat, K; Katlama, C; Gras, G; Bouchaud, O; Duracinsky, M; Abe, E; Alvarez, J C; Izopet, J; Saillard, J; Melchior, J C; Leibowitch, J; Costagliola, D; Girard, P M; Perronne, C; Group, Anrs Study D

Four-days-a-week antiretroviral maintenance therapy in virologically controlled HIV-1-infected adults: the ANRS 162-4D trial Article de journal

J Antimicrob Chemother, 2017, ISSN: 1460-2091 (Electronic) 0305-7453 (Linking).

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2016

Abravanel, F; Barrague, H; Dorr, G; Saune, K; Peron, J M; Alric, L; Kamar, N; Izopet, J; Champagne, E

Conventional and innate lymphocytes response at the acute phase of HEV infection in transplanted patients Article de journal

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El Costa, H; Gouilly, J; Mansuy, J M; Chen, Q; Levy, C; Cartron, G; Veas, F; Al-Daccak, R; Izopet, J; Jabrane-Ferrat, N

ZIKA virus reveals broad tissue and cell tropism during the first trimester of pregnancy Article de journal

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Gasser, R; Hamoudi, M; Pellicciotta, M; Zhou, Z; Visdeloup, C; Colin, P; Braibant, M; Lagane, B; Negroni, M

Buffering deleterious polymorphisms in highly constrained parts of HIV-1 envelope by flexible regions Article de journal

Retrovirology, 13 (1), p. 50, 2016, ISSN: 1742-4690 (Electronic) 1742-4690 (Linking).

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Loiseau, C; Requena, M; Mavigner, M; Cazabat, M; Carrere, N; Suc, B; Barange, K; Alric, L; Marchou, B; Massip, P; Izopet, J; Delobel, P

CCR6(-) regulatory T cells blunt the restoration of gut Th17 cells along the CCR6-CCL20 axis in treated HIV-1-infected individuals Article de journal

Mucosal Immunol, 9 (5), p. 1137-50, 2016, ISSN: 1935-3456 (Electronic) 1933-0219 (Linking).

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Mansuy, J M; Dutertre, M; Mengelle, C; Fourcade, C; Marchou, B; Delobel, P; Izopet, J; Martin-Blondel, G

Zika virus: high infectious viral load in semen, a new sexually transmitted pathogen? Article de journal

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Benureau, Y; Colin, P; Staropoli, I; Gonzalez, N; Garcia-Perez, J; Alcami, J; Arenzana-Seisdedos, F; Lagane, B

Guidelines for cloning, expression, purification and functional characterization of primary HIV-1 envelope glycoproteins Article de journal

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Planes, R; Ben Haij, N; Leghmari, K; Serrero, M; BenMohamed, L; Bahraoui, E

HIV-1 Tat Protein Activates both the MyD88 and TRIF Pathways To Induce Tumor Necrosis Factor Alpha and Interleukin-10 in Human Monocytes Article de journal

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2015

Garcia-Perez, J; Staropoli, I; Azoulay, S; Heinrich, J T; Cascajero, A; Colin, P; Lortat-Jacob, H; Arenzana-Seisdedos, F; Alcami, J; Kellenberger, E; Lagane, B

A single-residue change in the HIV-1 V3 loop associated with maraviroc resistance impairs CCR5 binding affinity while increasing replicative capacity Article de journal

Retrovirology, 12 , p. 50, 2015, ISSN: 1742-4690 (Electronic) 1742-4690 (Linking).

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Jeanne, N; Saliou, A; Carcenac, R; Lefebvre, C; Dubois, M; Cazabat, M; Nicot, F; Loiseau, C; Raymond, S; Izopet, J; Delobel, P

Position-specific automated processing of V3 env ultra-deep pyrosequencing data for predicting HIV-1 tropism Article de journal

Sci Rep, 5 , p. 16944, 2015, ISSN: 2045-2322 (Electronic) 2045-2322 (Linking).

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Lhomme, S; Kamar, N; Nicot, F; Ducos, J; Bismuth, M; Garrigue, V; Petitjean-Lecherbonnier, J; Ollivier, I; Alessandri-Gradt, E; Goria, O; Barth, H; Perrin, P; Saune, K; Dubois, M; Carcenac, R; Lefebvre, C; Jeanne, N; Abravanel, F; Izopet, J

Mutation in the Hepatitis E Virus Polymerase and Outcome of Ribavirin Therapy Article de journal

Antimicrob Agents Chemother, 60 (3), p. 1608-14, 2015, ISSN: 1098-6596 (Electronic) 0066-4804 (Linking).

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Siewiera, J; Gouilly, J; Hocine, H R; Cartron, G; Levy, C; Al-Daccak, R; Jabrane-Ferrat, N

Natural cytotoxicity receptor splice variants orchestrate the distinct functions of human natural killer cell subtypes Article de journal

Nat Commun, 6 , p. 10183, 2015, ISSN: 2041-1723 (Electronic) 2041-1723 (Linking).

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Ben Haij, N; Planes, R; Leghmari, K; Serrero, M; Delobel, P; Izopet, J; BenMohamed, L; Bahraoui, E

HIV-1 Tat Protein Induces Production of Proinflammatory Cytokines by Human Dendritic Cells and Monocytes/Macrophages through Engagement of TLR4-MD2-CD14 Complex and Activation of NF-kappaB Pathway Article de journal

PLoS One, 10 (6), p. e0129425, 2015, ISSN: 1932-6203 (Electronic) 1932-6203 (Linking).

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Ainaoui, N; Hantelys, F; Renaud-Gabardos, E; Bunel, M; Lopez, F; Pujol, F; Planes, R; Bahraoui, E; Pichereaux, C; Burlet-Schiltz, O; Parini, A; Garmy-Susini, B; Prats, A C

Promoter-Dependent Translation Controlled by p54nrb and hnRNPM during Myoblast Differentiation Article de journal

PLoS One, 10 (9), p. e0136466, 2015, ISSN: 1932-6203 (Electronic) 1932-6203 (Linking).

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2014

Kamar, N; Izopet, J; Tripon, S; Bismuth, M; Hillaire, S; Dumortier, J; Radenne, S; Coilly, A; Garrigue, V; D'Alteroche, L; Buchler, M; Couzi, L; Lebray, P; Dharancy, S; Minello, A; Hourmant, M; Roque-Afonso, A M; Abravanel, F; Pol, S; Rostaing, L; Mallet, V

Ribavirin for chronic hepatitis E virus infection in transplant recipients Article de journal

N Engl J Med, 370 (12), p. 1111-20, 2014, ISSN: 1533-4406 (Electronic) 0028-4793 (Linking).

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Jabrane-Ferrat, N; Siewiera, J

The up side of decidual natural killer cells: new developments in immunology of pregnancy Article de journal

Immunology, 141 (4), p. 490-7, 2014, ISSN: 1365-2567 (Electronic) 0019-2805 (Linking).

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Lauden, L; Siewiera, J; Boukouaci, W; Ramgolam, K; Mourah, S; Lebbe, C; Charron, D; Aoudjit, F; Jabrane-Ferrat, N; Al-Daccak, R

TGF-beta-induced (TGFBI) protein in melanoma: a signature of high metastatic potential Article de journal

J Invest Dermatol, 134 (6), p. 1675-1685, 2014, ISSN: 1523-1747 (Electronic) 0022-202X (Linking).

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Boukouaci, W; Lauden, L; Siewiera, J; Dam, N; Hocine, H R; Khaznadar, Z; Tamouza, R; Borlado, L R; Charron, D; Jabrane-Ferrat, N; Al-Daccak, R

Natural killer cell crosstalk with allogeneic human cardiac-derived stem/progenitor cells controls persistence Article de journal

Cardiovasc Res, 104 (2), p. 290-302, 2014, ISSN: 1755-3245 (Electronic) 0008-6363 (Linking).

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Planes, R; BenMohamed, L; Leghmari, K; Delobel, P; Izopet, J; Bahraoui, E

HIV-1 Tat protein induces PD-L1 (B7-H1) expression on dendritic cells through tumor necrosis factor alpha- and toll-like receptor 4-mediated mechanisms Article de journal

J Virol, 88 (12), p. 6672-89, 2014, ISSN: 1098-5514 (Electronic) 0022-538X (Linking).

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Bahraoui, E; Briant, L; Chazal, N

E5564 inhibits immunosuppressive cytokine IL-10 induction promoted by HIV-1 Tat protein Article de journal

Virol J, 11 , p. 214, 2014, ISSN: 1743-422X (Electronic) 1743-422X (Linking).

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Impact sociétal

Connaissance de la biologie des virus à ARN et des mécanismes pathologiques

Notre recherche génère des connaissances fondamentales mais aussi des applications thérapeutiques sur des infections chroniques (HIV et HEV) ou émergentes (ZIKV) dont la physiopathologie reste à préciser. Les liens étroits avec les services cliniques du CHU de Toulouse et les plateaux techniques du CPTP assurent une réactivité optimale pour le développement de thématiques originales.

Alumni

PhD students:

Maud Mavigner (2008-2011)
Nawal Benhaji (2009-2013)
Adrien Saliou (2010-2013)
Johan Siewiera (2010-2014)
Claire Loiseau (2012-2015)
Charline Daguzan (2012-2015)
Hugo Barragué (2015-2018)
Jordi Gouilly (2015-2018)

Post Doctoral Fellow:

Sokunthea Top (2013-2014)
Romain Gasser (2016-2018)

INSERM

INSERM

CNRS

CNRS

ANRS

ANRS

Sidaction

Sidaction

Hôpitaux de Toulouse

Hôpitaux de Toulouse

Agence de la biomédecine

Agence de la biomédecine

UT3

UT3